Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms