Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms