Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCGF6Q9BYE7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms