Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms