Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms