Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms