Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms