Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms