Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms