Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms