Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP88Q99567 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms