Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms