Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
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