Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms