Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RUNDC1Q96C34 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms