Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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UBE2E3Q969T4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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