Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX21Q969T3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms