Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms