Protein–RNA interactions for Protein: Q93063

EXT2, Exostosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT2Q93063 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXT2Q93063 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXT2Q93063 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXT2Q93063 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXT2Q93063 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXT2Q93063 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXT2Q93063 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXT2Q93063 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXT2Q93063 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXT2Q93063 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXT2Q93063 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXT2Q93063 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EXT2Q93063 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EXT2Q93063 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EXT2Q93063 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EXT2Q93063 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EXT2Q93063 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EXT2Q93063 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EXT2Q93063 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EXT2Q93063 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EXT2Q93063 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXT2Q93063 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms