Protein–RNA interactions for Protein: Q92537

SUSD6, Sushi domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD6Q92537 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD6Q92537 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD6Q92537 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms