Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTTNBP2Q8WZ74 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms