Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPBAR1Q8TDU6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms