Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTROBQ8N137 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTROBQ8N137 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTROBQ8N137 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTROBQ8N137 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTROBQ8N137 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTROBQ8N137 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTROBQ8N137 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTROBQ8N137 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTROBQ8N137 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTROBQ8N137 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTROBQ8N137 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTROBQ8N137 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTROBQ8N137 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTROBQ8N137 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTROBQ8N137 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTROBQ8N137 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTROBQ8N137 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTROBQ8N137 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTROBQ8N137 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTROBQ8N137 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTROBQ8N137 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTROBQ8N137 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTROBQ8N137 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTROBQ8N137 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTROBQ8N137 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTROBQ8N137 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTROBQ8N137 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTROBQ8N137 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTROBQ8N137 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNTROBQ8N137 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms