Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SKAP1Q86WV1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms