Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms