Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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