Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms