Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms