Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms