Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ08

SPANXN4, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN4Q5MJ08 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SPANXN4Q5MJ08 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN4Q5MJ08 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN4Q5MJ08 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN4Q5MJ08 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN4Q5MJ08 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN4Q5MJ08 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN4Q5MJ08 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN4Q5MJ08 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN4Q5MJ08 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN4Q5MJ08 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN4Q5MJ08 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN4Q5MJ08 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN4Q5MJ08 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms