Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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