Protein–RNA interactions for Protein: Q52LG2

KRTAP13-2, Keratin-associated protein 13-2, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-2Q52LG2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
KRTAP13-2Q52LG2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms