Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms