Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms