Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms