Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms