Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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