Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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