Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SYPL1Q16563 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SYPL1Q16563 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SYPL1Q16563 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SYPL1Q16563 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SYPL1Q16563 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SYPL1Q16563 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SYPL1Q16563 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SYPL1Q16563 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYPL1Q16563 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYPL1Q16563 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SYPL1Q16563 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SYPL1Q16563 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYPL1Q16563 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYPL1Q16563 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SYPL1Q16563 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYPL1Q16563 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SYPL1Q16563 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SYPL1Q16563 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYPL1Q16563 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SYPL1Q16563 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYPL1Q16563 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYPL1Q16563 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SYPL1Q16563 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYPL1Q16563 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SYPL1Q16563 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYPL1Q16563 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYPL1Q16563 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYPL1Q16563 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYPL1Q16563 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYPL1Q16563 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYPL1Q16563 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYPL1Q16563 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYPL1Q16563 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYPL1Q16563 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYPL1Q16563 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYPL1Q16563 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYPL1Q16563 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SYPL1Q16563 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SYPL1Q16563 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYPL1Q16563 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYPL1Q16563 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYPL1Q16563 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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SYPL1Q16563 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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SYPL1Q16563 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYPL1Q16563 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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