Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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E2F4Q16254 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
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E2F4Q16254 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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E2F4Q16254 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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E2F4Q16254 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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E2F4Q16254 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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E2F4Q16254 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms