Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms