Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SS18Q15532 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SS18Q15532 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SS18Q15532 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SS18Q15532 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SS18Q15532 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SS18Q15532 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SS18Q15532 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SS18Q15532 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SS18Q15532 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SS18Q15532 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SS18Q15532 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SS18Q15532 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SS18Q15532 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SS18Q15532 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SS18Q15532 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SS18Q15532 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SS18Q15532 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SS18Q15532 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SS18Q15532 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SS18Q15532 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
SS18Q15532 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SS18Q15532 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SS18Q15532 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
SS18Q15532 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SS18Q15532 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms