Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms