Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms