Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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