Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms