Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms