Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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