Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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