Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms